Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDZK1Q5T2W1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDZK1Q5T2W1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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