Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
WDR44Q5JSH3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WDR44Q5JSH3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WDR44Q5JSH3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms