Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC4Q5J8M3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms