Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XKR3Q5GH77 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XKR3Q5GH77 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR3Q5GH77 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms