Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KHDC3LQ587J8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KHDC3LQ587J8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms