Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD12Q587J7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TDRD12Q587J7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TDRD12Q587J7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms