Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC23Q53EV4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.9 ms