Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
KRTAP13-3Q3SY46 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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KRTAP13-3Q3SY46 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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