Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDUFAF6Q330K2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDUFAF6Q330K2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NDUFAF6Q330K2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms