Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RFX7Q2KHR2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RFX7Q2KHR2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RFX7Q2KHR2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms