Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLPPQ16740 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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