Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CARTPTQ16568 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CARTPTQ16568 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CARTPTQ16568 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CARTPTQ16568 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CARTPTQ16568 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CARTPTQ16568 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CARTPTQ16568 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CARTPTQ16568 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms