Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PTPRKQ15262 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.7■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRKQ15262 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRKQ15262 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
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