Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CNGB1Q14028 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CNGB1Q14028 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNGB1Q14028 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
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