Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CKAP5Q14008 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKAP5Q14008 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKAP5Q14008 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms