Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD4Q13485 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMAD4Q13485 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAD4Q13485 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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