Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR1H3Q13133 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1H3Q13133 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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