Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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RAB40BQ12829 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RAB40BQ12829 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RAB40BQ12829 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RAB40BQ12829 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB40BQ12829 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RAB40BQ12829 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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RAB40BQ12829 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB40BQ12829 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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RAB40BQ12829 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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RAB40BQ12829 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB40BQ12829 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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RAB40BQ12829 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB40BQ12829 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB40BQ12829 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB40BQ12829 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB40BQ12829 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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