Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 RPL7BYPL198W 735 nt5.1□□□□□ -1.59
PRP46Q12417 YLH47YPR125W 1365 nt5.1□□□□□ -1.59
PRP46Q12417 HAS1YMR290C 1518 nt5.09□□□□□ -1.59
PRP46Q12417 BUL1YMR275C 2931 nt5.09□□□□□ -1.59
PRP46Q12417 MRP51YPL118W 1035 nt5.09□□□□□ -1.59
PRP46Q12417 ECM2YBR065C 1095 nt5.09□□□□□ -1.59
PRP46Q12417 CRZ1YNL027W 2037 nt5.09□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 YDL057WYDL057W 987 nt5.08□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 SNZ3YFL059W 897 nt5.08□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 YGR176WYGR176W 348 nt5.08□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 YKL107WYKL107W 930 nt5.08□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 YLR194CYLR194C 765 nt5.08□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 DAL82YNL314W 768 nt5.08□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 SNZ2YNL333W 897 nt5.08□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 SKN1YGR143W 2316 nt5.08□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 VAN1YML115C 1608 nt5.08□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 ABZ1YNR033W 2364 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 YEH1YLL012W 1722 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 URA7YBL039C 1740 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 PDE1YGL248W 1110 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 BNS1YGR230W 414 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 CBT1YKL208W 816 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 TFS1YLR178C 660 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 ARG1YOL058W 1263 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 NPT1YOR209C 1290 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 ODC2YOR222W 924 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 SMF2YHR050W 1650 nt5.07□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 STL1YDR536W 1710 nt5.06□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.06□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 PIN2YOR104W 849 nt5.06□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 PZF1YPR186C 1290 nt5.06□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 PKC1YBL105C 3456 nt5.06□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 QDR3YBR043C 2070 nt5.06□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 VPS5YOR069W 2028 nt5.06□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 SAC6YDR129C 1929 nt5.05□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 YAP1801YHR161C 1914 nt5.05□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 RTT106YNL206C 1368 nt5.05□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 MTC5YDR128W 3447 nt5.05□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 CTR2YHR175W 570 nt5.05□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 GEP5YLR091W 882 nt5.05□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 ELA1YNL230C 1140 nt5.05□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 ATP1YBL099W 1638 nt5.05□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 UBX2YML013W 1755 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 UGO1YDR470C 1509 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 COX26YDR119W-A 201 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 GIR2YDR152W 798 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 DAL3YIR032C 588 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 PGU1YJR153W 1086 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 TUL1YKL034W 2277 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 TRK2YKR050W 2670 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 MID1YNL291C 1647 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 STB5YHR178W 2232 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 NUD1YOR373W 2556 nt5.04□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 MRC1YCL061C 3291 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 IPK1YDR315C 846 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 RHO3YIL118W 696 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 YJR115WYJR115W 510 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 HCR1YLR192C 798 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 PGA3YML125C 939 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 GFD1YMR255W 567 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 SHE10YGL228W 1734 nt5.03□□□□□ -1.6
PRP46Q12417 BZZ1YHR114W 1902 nt5.02□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 SRG1SRG1 551 nt5.02□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 CAD1YDR423C 1230 nt5.02□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 SWP1YMR149W 861 nt5.02□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 ENV9YOR246C 993 nt5.02□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.02□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 FLC3YGL139W 2409 nt5.01□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 PEX7YDR142C 1128 nt5.01□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 MLC1YGL106W 450 nt5.01□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 RBD2YPL246C 789 nt5.01□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 HAL1YPR005C 885 nt5.01□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 GUA1YMR217W 1578 nt5□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 VMA13YPR036W 1437 nt5□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 RPL12AYEL054C 498 nt5□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 HSP150YJL159W 1242 nt5□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 COS9YKL219W 1224 nt5□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 YOL131WYOL131W 327 nt5□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 ALT1YLR089C 1779 nt5□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 STE13YOR219C 2796 nt4.99□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 VBA1YMR088C 1689 nt4.99□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 MPP10YJR002W 1782 nt4.99□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 ARP2YDL029W 1176 nt4.99□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 YDL034WYDL034W 345 nt4.99□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 HOF1YMR032W 2010 nt4.99□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 CLB1YGR108W 1416 nt4.98□□□□□ -1.61
PRP46Q12417 IDP1YDL066W 1287 nt4.98□□□□□ -1.61
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