Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YKR045CYKR045C 552 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 FDH1YOR388C 1131 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 USV1YPL230W 1176 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 NOB1YOR056C 1380 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 DBP5YOR046C 1449 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 GPH1YPR160W 2709 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 IRC5YFR038W 2562 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 ERS1YCR075C 783 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YDL124WYDL124W 939 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 SNF11YDR073W 510 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YDR278CYDR278C 318 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 TRS31YDR472W 852 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 PIL1YGR086C 1020 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YBL029WYBL029W 1131 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YOR152CYOR152C 771 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 YPL102CYPL102C 303 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 TAH11YJR046W 1815 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-NL1Q12391 CEM1YER061C 1329 nt6.4□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 GSH1YJL101C 2037 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 ATC1YDR184C 885 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 BMH1YER177W 804 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 BTN2YGR142W 1233 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 THR1YHR025W 1074 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 DID4YKL002W 699 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MEU1YLR017W 1014 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 NBP1YLR457C 960 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YBR063CYBR063C 1215 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 PWR1PWR1 941 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 VPS36YLR417W 1701 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 POX1YGL205W 2247 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 HST4YDR191W 1113 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YGL230CYGL230C 444 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 RPL2BYIL018W 765 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 RPI1YIL119C 1224 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 AIM25YJR100C 984 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 CMC1YKL137W 336 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MRPL4YLR439W 960 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 SAS5YOR213C 747 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 SDH8YBR269C 417 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 DXO1YDR370C 1329 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 GDH1YOR375C 1365 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 CCT3YJL014W 1605 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 DLD1YDL174C 1764 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MSG5YNL053W 1470 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 CTF13YMR094W 1437 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 PTC1YDL006W 846 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 QRI7YDL104C 1224 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YIP5YGL161C 933 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 HGH1YGR187C 1185 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 IPI1YHR085W 1005 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 PSF2YJL072C 642 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MBR1YKL093W 1020 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 GPN3YLR243W 819 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 ADH6YMR318C 1083 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 EAF7YNL136W 1278 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 PDR16YNL231C 1056 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MGE1YOR232W 687 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 LAG2YOL025W 1983 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 CPR1YDR155C 489 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 SPT3YDR392W 1014 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MRPL28YDR462W 444 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 GIM4YEL003W 336 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MTC7YEL033W 420 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 COBQ0105 1158 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MIA40YKL195W 1212 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 SML1YML058W 315 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 RRN10YBL025W 438 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YBR053CYBR053C 1077 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 HBN1YCL026C-B 582 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 TFC6YDR362C 2019 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 ICL2YPR006C 1728 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 CTA1YDR256C 1548 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YHL012WYHL012W 1482 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YBR241CYBR241C 1467 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 GCN5YGR252W 1320 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 RNH202YDR279W 1053 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YGL081WYGL081W 963 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 NCA3YJL116C 1014 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 IME1YJR094C 1083 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 SMD2YLR275W 333 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 GMC2YLR445W 567 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 DLT1YMR126C 1029 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 PGA2YNL149C 390 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 PIN2YOR104W 849 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 SPO19YPL130W 672 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 CSH1YBR161W 1131 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MSI1YBR195C 1269 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YDR282CYDR282C 1245 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 HPT1YDR399W 666 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 TEX1YNL253W 1269 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 TPT1YOL102C 693 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 YOR364WYOR364W 369 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 ENV7YPL236C 1095 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-NL1Q12391 MCH1YDL054C 1461 nt6.34□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 YLL066CYLL066C 3618 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 AIR2YDL175C 1035 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 KEG1YFR042W 603 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-NL1Q12391 PRS4YBL068W 981 nt6.33□□□□□ -1.4
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