Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NIPAL4Q0D2K0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NIPAL4Q0D2K0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NIPAL4Q0D2K0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms