Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF4Q08170 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SRSF4Q08170 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms