Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4BQ07343 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDE4BQ07343 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE4BQ07343 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE4BQ07343 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms