Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 219.06■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 31.7
FMR1Q06787 FHOD1-210ENST00000569888 780 ntTSL 218■□□□□ 0.474e-11■■■■■ 31.7
FMR1Q06787 FHOD1-207ENST00000567752 4321 ntTSL 216.66■□□□□ 0.264e-11■■■■■ 31.7
FMR1Q06787 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-11■■■■■ 31.7
FMR1Q06787 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)12.52□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 31.7
FMR1Q06787 FLNA-208ENST00000438732 696 ntTSL 521.88■■□□□ 1.092e-14■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.739e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-203ENST00000371674 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-217ENST00000486653 563 ntTSL 412.34□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-206ENST00000415862 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-216ENST00000483534 1155 ntTSL 1 (best)10.79□□□□□ -0.689e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-211ENST00000467839 566 ntTSL 210.79□□□□□ -0.689e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.799e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-205ENST00000396059 1983 ntTSL 1 (best)9.92□□□□□ -0.829e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.929e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-219ENST00000490555 549 ntTSL 47.91□□□□□ -1.149e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-221ENST00000493090 563 ntTSL 47.53□□□□□ -1.29e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-220ENST00000492371 535 ntTSL 37.53□□□□□ -1.29e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-208ENST00000432266 569 ntTSL 47.33□□□□□ -1.249e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 UBE2V1-214ENST00000472923 421 ntTSL 55.5□□□□□ -1.539e-7■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 31.6
FMR1Q06787 EIF4G1-231ENST00000464548 637 ntTSL 515.42■□□□□ 0.061e-11■■■■■ 31.5
FMR1Q06787 DDB1-218ENST00000540784 1119 ntTSL 318.71■□□□□ 0.596e-8■■■■■ 31.5
FMR1Q06787 LTBP4-238ENST00000622457 547 ntTSL 215.22■□□□□ 0.033e-12■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.552e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 CREB1-204ENST00000421139 713 ntTSL 521.75■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.82e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 CREB1-211ENST00000452474 518 ntTSL 48.32□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 CREB1-216ENST00000494094 580 ntTSL 28.32□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 CREB1-207ENST00000445803 651 ntTSL 44.72□□□□□ -1.652e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 GTPBP4-205ENST00000491635 2220 ntTSL 211.17□□□□□ -0.624e-8■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.231e-16■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.384e-8■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.414e-8■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 EIF3I-201ENST00000355082 564 ntTSL 319.34■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 217.64■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 EIF3I-205ENST00000483517 744 ntTSL 517.01■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 215.69■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 EIF3I-203ENST00000471486 825 ntTSL 214.53□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 EIF3I-202ENST00000373586 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 PELP1-215ENST00000575534 601 ntTSL 313.47□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 EIF3I-206ENST00000489353 527 ntTSL 312.95□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 EIF3I-204ENST00000474371 643 ntTSL 38.7□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 31.4
FMR1Q06787 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.935e-8■■■■■ 31.3
FMR1Q06787 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.855e-8■■■■■ 31.3
FMR1Q06787 EPRS-205ENST00000485821 598 ntTSL 39.44□□□□□ -0.91e-10■■■■■ 31.3
FMR1Q06787 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.123e-11■■■■■ 31.2
FMR1Q06787 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.083e-11■■■■■ 31.2
FMR1Q06787 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 221.54■■□□□ 1.043e-11■■■■■ 31.2
FMR1Q06787 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 415.29■□□□□ 0.043e-11■■■■■ 31.2
FMR1Q06787 MCM4-212ENST00000521151 1125 ntTSL 211.66□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 SYDE2-201ENST00000234668 3000 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.736e-9■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 ICE1-202ENST00000505464 1074 ntTSL 226.54■■□□□ 1.842e-8■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 ICE1-203ENST00000512608 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.01□□□□□ -1.292e-8■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 POLR2A-205ENST00000576114 245 ntTSL 210.26□□□□□ -0.779e-11■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-212ENST00000522761 1763 ntTSL 220.24■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-213ENST00000523519 535 ntTSL 419.52■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-209ENST00000520578 530 ntTSL 317.89■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-208ENST00000520177 2700 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-203ENST00000507878 577 ntTSL 415.13■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-204ENST00000517947 558 ntTSL 414.8□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-210ENST00000522367 580 ntTSL 314.8□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-201ENST00000356245 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-205ENST00000518726 869 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 G3BP1-206ENST00000519832 1173 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 31.1
FMR1Q06787 DDB1-205ENST00000535174 896 ntTSL 321.43■■□□□ 1.029e-8■■■■■ 31
FMR1Q06787 DDB1-225ENST00000545930 1278 ntTSL 211.27□□□□□ -0.619e-8■■■■■ 31
FMR1Q06787 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 31
FMR1Q06787 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 31
FMR1Q06787 PNPLA6-212ENST00000595352 563 ntTSL 315.62■□□□□ 0.094e-8■■■■■ 31
FMR1Q06787 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.014e-8■■■■■ 31
FMR1Q06787 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 31
FMR1Q06787 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 31
FMR1Q06787 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 31
FMR1Q06787 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 31
FMR1Q06787 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 31
FMR1Q06787 PRKDC-208ENST00000536710 554 ntTSL 48.87□□□□□ -0.996e-11■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.761e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-222ENST00000479679 894 ntTSL 229.57■■■□□ 2.321e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-208ENST00000430807 733 ntTSL 328.7■■■□□ 2.181e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.121e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-206ENST00000411907 568 ntTSL 427.44■■□□□ 1.981e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 527.01■■□□□ 1.911e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.891e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.841e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.741e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 BOP1-201ENST00000563210 642 ntTSL 225.8■■□□□ 1.721e-8■■■■■ 30.9
FMR1Q06787 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.651e-8■■■■■ 30.9
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 64.9 ms