Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNP2Q05952 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNP2Q05952 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms