Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPN12Q05209 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPN12Q05209 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPN12Q05209 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPN12Q05209 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms