Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSF1Q00613 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSF1Q00613 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms