Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4AP68366 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA4AP68366 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms