Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGDP52209 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGDP52209 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGDP52209 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGDP52209 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGDP52209 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGDP52209 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGDP52209 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGDP52209 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGDP52209 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGDP52209 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGDP52209 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGDP52209 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGDP52209 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGDP52209 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGDP52209 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGDP52209 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGDP52209 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGDP52209 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGDP52209 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGDP52209 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGDP52209 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGDP52209 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGDP52209 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGDP52209 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGDP52209 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGDP52209 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGDP52209 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGDP52209 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGDP52209 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGDP52209 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGDP52209 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGDP52209 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGDP52209 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGDP52209 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGDP52209 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGDP52209 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGDP52209 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGDP52209 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGDP52209 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGDP52209 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGDP52209 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGDP52209 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGDP52209 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGDP52209 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGDP52209 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGDP52209 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGDP52209 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGDP52209 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGDP52209 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGDP52209 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGDP52209 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGDP52209 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGDP52209 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGDP52209 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGDP52209 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGDP52209 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGDP52209 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGDP52209 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGDP52209 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGDP52209 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGDP52209 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGDP52209 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGDP52209 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGDP52209 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGDP52209 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms