Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IDH3AP50213 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms