Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PITPNBP48739 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms