Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCAMP43121 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCAMP43121 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MCAMP43121 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
MCAMP43121 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCAMP43121 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCAMP43121 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCAMP43121 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MCAMP43121 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MCAMP43121 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MCAMP43121 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MCAMP43121 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCAMP43121 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCAMP43121 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MCAMP43121 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MCAMP43121 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCAMP43121 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCAMP43121 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCAMP43121 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MCAMP43121 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCAMP43121 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCAMP43121 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MCAMP43121 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCAMP43121 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCAMP43121 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MCAMP43121 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MCAMP43121 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCAMP43121 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCAMP43121 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCAMP43121 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCAMP43121 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCAMP43121 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCAMP43121 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCAMP43121 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCAMP43121 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCAMP43121 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCAMP43121 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCAMP43121 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCAMP43121 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCAMP43121 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCAMP43121 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCAMP43121 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCAMP43121 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCAMP43121 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCAMP43121 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCAMP43121 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCAMP43121 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCAMP43121 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCAMP43121 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCAMP43121 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCAMP43121 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCAMP43121 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCAMP43121 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCAMP43121 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCAMP43121 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCAMP43121 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCAMP43121 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCAMP43121 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCAMP43121 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCAMP43121 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCAMP43121 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCAMP43121 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MCAMP43121 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCAMP43121 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCAMP43121 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCAMP43121 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCAMP43121 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCAMP43121 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCAMP43121 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCAMP43121 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCAMP43121 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCAMP43121 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCAMP43121 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCAMP43121 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCAMP43121 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCAMP43121 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCAMP43121 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCAMP43121 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCAMP43121 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCAMP43121 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCAMP43121 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCAMP43121 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms