Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC1A3P43003 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC1A3P43003 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC1A3P43003 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms