Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL13AP40429 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL13AP40429 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPL13AP40429 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms