Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNA1P35221 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTNNA1P35221 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTNNA1P35221 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms