Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER1P34995 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER1P34995 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms