Protein–RNA interactions for Protein: P34167

TIF3, Eukaryotic translation initiation factor 4B, yeast

Known RBP Predictions only

Length 436 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIF3	P34167	RPN5	YDL147W	1338 nt		5.6	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	LIA1	YJR070C	978 nt		5.6	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	SFC1	YJR095W	969 nt		5.6	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	TSR2	YLR435W	618 nt		5.6	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	PDC1	YLR044C	1692 nt		5.59	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	YMR155W	YMR155W	1644 nt		5.59	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	YBR138C	YBR138C	1575 nt		5.59	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	DFG5	YMR238W	1377 nt		5.59	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	YEA6	YEL006W	1008 nt		5.59	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	LDS1	YAL018C	978 nt		5.59	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	MED4	YOR174W	855 nt		5.59	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	MRPS16	YPL013C	366 nt		5.59	□□□□□ -1.51
TIF3	P34167	SEC39	YLR440C	2130 nt		5.59	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	CYS4	YGR155W	1524 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YHR182W	YHR182W	2358 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	RPT2	YDL007W	1314 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	GPI18	YBR004C	1302 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	NRD1	YNL251C	1728 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YDL121C	YDL121C	450 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	KSS1	YGR040W	1107 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	POR2	YIL114C	846 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	KRE9	YJL174W	831 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	MRPL24	YMR193W	777 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	GFD1	YMR255W	567 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	MRPS18	YNL306W	654 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	PSH1	YOL054W	1221 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YBR027C	YBR027C	333 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	VMS1	YDR049W	1899 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	NHA1	YLR138W	2958 nt		5.58	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	GRS1	YBR121C	2004 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	WHI4	YDL224C	1950 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YDL218W	YDL218W	954 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YIR043C	YIR043C	693 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	SRY1	YKL218C	981 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YKR073C	YKR073C	321 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	RRT7	YLL030C	342 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YML131W	YML131W	1098 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YPR098C	YPR098C	486 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	MKC7	YDR144C	1791 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	HXT5	YHR096C	1779 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	SAL1	YNL083W	1485 nt		5.57	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	FET3	YMR058W	1911 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	ERG8	YMR220W	1356 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YER084W	YER084W	387 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	GCG1	YER163C	699 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YFR035C	YFR035C	345 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	MTQ1	YNL063W	945 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YOL079W	YOL079W	399 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YRF1-4	YLR466W	4149 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	NOC4	YPR144C	1659 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	PSE1	YMR308C	3270 nt		5.56	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	HPF1	YOL155C	2904 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	VTH1	YIL173W	4650 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	VTH2	YJL222W	4650 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	PEX19	YDL065C	1029 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	UGX2	YDL169C	672 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	ASK1	YKL052C	879 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	AAT2	YLR027C	1257 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	DOM34	YNL001W	1161 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YPL071C	YPL071C	471 nt		5.55	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	FOB1	YDR110W	1701 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YEL077C	YEL077C	3834 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	UIP5	YKR044W	1332 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YET3	YDL072C	612 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	HEM3	YDL205C	984 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	SRG1	SRG1	551 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	ECT1	YGR007W	972 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	DJP1	YIR004W	1299 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	HAP3	YBL021C	435 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	YMR122C	YMR122C	375 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	HOR7	YMR251W-A	180 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	TIP41	YPR040W	1071 nt		5.54	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	PPR1	YLR014C	2715 nt		5.53	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	MRPL35	YDR322W	1104 nt		5.53	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	SPG4	YMR107W	348 nt		5.53	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	SEC17	YBL050W	879 nt		5.53	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	HEM15	YOR176W	1182 nt		5.53	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	ALG5	YPL227C	1005 nt		5.53	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	RVB2	YPL235W	1416 nt		5.53	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	PDH1	YPR002W	1551 nt		5.53	□□□□□ -1.52
TIF3	P34167	CRF1	YDR223W	1404 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	YCR006C	YCR006C	474 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	RTT103	YDR289C	1230 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	SEC20	YDR498C	1152 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	SUP19	tS(UGA)E	82 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	SUP17	tS(UGA)I	82 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	SUP16	tS(UGA)P	82 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	YJR115W	YJR115W	510 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	SCP1	YOR367W	603 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	TOS3	YGL179C	1683 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	UTP18	YJL069C	1785 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	ADE6	YGR061C	4077 nt		5.52	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	RBA50	YDR527W	1320 nt		5.51	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	RAD24	YER173W	1980 nt		5.51	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	YML082W	YML082W	1950 nt		5.51	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	SRV2	YNL138W	1581 nt		5.51	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	SEC12	YNR026C	1416 nt		5.51	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	RAM1	YDL090C	1296 nt		5.51	□□□□□ -1.53
TIF3	P34167	YHR218W-A	YHR218W-A	318 nt		5.51	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.8 ms