Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX2P32243 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OTX2P32243 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX2P32243 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX2P32243 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX2P32243 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX2P32243 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX2P32243 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX2P32243 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX2P32243 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX2P32243 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX2P32243 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX2P32243 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX2P32243 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX2P32243 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX2P32243 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX2P32243 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX2P32243 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX2P32243 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX2P32243 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX2P32243 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX2P32243 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX2P32243 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX2P32243 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX2P32243 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX2P32243 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX2P32243 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX2P32243 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX2P32243 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX2P32243 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX2P32243 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX2P32243 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX2P32243 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX2P32243 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX2P32243 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX2P32243 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
OTX2P32243 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTX2P32243 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OTX2P32243 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTX2P32243 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTX2P32243 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTX2P32243 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTX2P32243 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OTX2P32243 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTX2P32243 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTX2P32243 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTX2P32243 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTX2P32243 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTX2P32243 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTX2P32243 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTX2P32243 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTX2P32243 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTX2P32243 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTX2P32243 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms