Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRMP28827 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRMP28827 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PTPRMP28827 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
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