Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
DNMT1P26358 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
DNMT1P26358 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
DNMT1P26358 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms