Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TACR1P25103 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TACR1P25103 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TACR1P25103 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TACR1P25103 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TACR1P25103 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TACR1P25103 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TACR1P25103 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TACR1P25103 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TACR1P25103 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TACR1P25103 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TACR1P25103 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TACR1P25103 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TACR1P25103 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TACR1P25103 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TACR1P25103 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TACR1P25103 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TACR1P25103 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TACR1P25103 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TACR1P25103 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TACR1P25103 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TACR1P25103 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TACR1P25103 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR1P25103 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR1P25103 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR1P25103 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR1P25103 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR1P25103 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TACR1P25103 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR1P25103 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR1P25103 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR1P25103 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR1P25103 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR1P25103 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR1P25103 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR1P25103 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TACR1P25103 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TACR1P25103 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TACR1P25103 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TACR1P25103 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TACR1P25103 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TACR1P25103 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TACR1P25103 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TACR1P25103 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TACR1P25103 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR1P25103 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR1P25103 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR1P25103 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR1P25103 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR1P25103 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR1P25103 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR1P25103 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR1P25103 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TACR1P25103 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR1P25103 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR1P25103 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR1P25103 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR1P25103 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR1P25103 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TACR1P25103 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TACR1P25103 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TACR1P25103 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms