Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCHP24723 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKCHP24723 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCHP24723 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms