Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYF6P23409 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYF6P23409 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYF6P23409 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYF6P23409 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYF6P23409 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYF6P23409 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYF6P23409 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF6P23409 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF6P23409 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF6P23409 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF6P23409 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF6P23409 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF6P23409 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF6P23409 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF6P23409 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYF6P23409 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYF6P23409 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYF6P23409 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF6P23409 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF6P23409 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF6P23409 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF6P23409 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYF6P23409 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF6P23409 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF6P23409 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF6P23409 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF6P23409 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF6P23409 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF6P23409 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF6P23409 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYF6P23409 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF6P23409 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF6P23409 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF6P23409 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF6P23409 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF6P23409 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF6P23409 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MYF6P23409 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYF6P23409 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF6P23409 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF6P23409 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF6P23409 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF6P23409 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF6P23409 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF6P23409 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYF6P23409 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms