Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME2P23368 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME2P23368 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME2P23368 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME2P23368 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME2P23368 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME2P23368 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME2P23368 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME2P23368 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME2P23368 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME2P23368 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME2P23368 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME2P23368 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME2P23368 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ME2P23368 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ME2P23368 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME2P23368 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ME2P23368 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME2P23368 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME2P23368 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME2P23368 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME2P23368 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME2P23368 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME2P23368 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME2P23368 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME2P23368 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME2P23368 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME2P23368 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME2P23368 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME2P23368 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME2P23368 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME2P23368 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME2P23368 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME2P23368 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME2P23368 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME2P23368 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME2P23368 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME2P23368 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME2P23368 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME2P23368 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME2P23368 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME2P23368 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME2P23368 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME2P23368 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME2P23368 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME2P23368 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME2P23368 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME2P23368 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME2P23368 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME2P23368 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME2P23368 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ME2P23368 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ME2P23368 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME2P23368 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME2P23368 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ME2P23368 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME2P23368 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME2P23368 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME2P23368 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME2P23368 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME2P23368 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME2P23368 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ME2P23368 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME2P23368 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ME2P23368 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME2P23368 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ME2P23368 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ME2P23368 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms