Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCP2P22307 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCP2P22307 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCP2P22307 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCP2P22307 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCP2P22307 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCP2P22307 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCP2P22307 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCP2P22307 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCP2P22307 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCP2P22307 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCP2P22307 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCP2P22307 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCP2P22307 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCP2P22307 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCP2P22307 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCP2P22307 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCP2P22307 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCP2P22307 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCP2P22307 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCP2P22307 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCP2P22307 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCP2P22307 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCP2P22307 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCP2P22307 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCP2P22307 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCP2P22307 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCP2P22307 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCP2P22307 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCP2P22307 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCP2P22307 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCP2P22307 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCP2P22307 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCP2P22307 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCP2P22307 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCP2P22307 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCP2P22307 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCP2P22307 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCP2P22307 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCP2P22307 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCP2P22307 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCP2P22307 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCP2P22307 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCP2P22307 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCP2P22307 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCP2P22307 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCP2P22307 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCP2P22307 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCP2P22307 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCP2P22307 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCP2P22307 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCP2P22307 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCP2P22307 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCP2P22307 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCP2P22307 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCP2P22307 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCP2P22307 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCP2P22307 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCP2P22307 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCP2P22307 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCP2P22307 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCP2P22307 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCP2P22307 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCP2P22307 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCP2P22307 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCP2P22307 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCP2P22307 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCP2P22307 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCP2P22307 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCP2P22307 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCP2P22307 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCP2P22307 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCP2P22307 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCP2P22307 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCP2P22307 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCP2P22307 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCP2P22307 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCP2P22307 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCP2P22307 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCP2P22307 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCP2P22307 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCP2P22307 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCP2P22307 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCP2P22307 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCP2P22307 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCP2P22307 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCP2P22307 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCP2P22307 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCP2P22307 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCP2P22307 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCP2P22307 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms