Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN3P20807 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPN3P20807 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPN3P20807 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms