Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LIG1P18858 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIG1P18858 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIG1P18858 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIG1P18858 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIG1P18858 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LIG1P18858 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIG1P18858 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIG1P18858 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIG1P18858 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIG1P18858 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIG1P18858 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIG1P18858 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIG1P18858 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIG1P18858 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIG1P18858 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIG1P18858 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIG1P18858 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LIG1P18858 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIG1P18858 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIG1P18858 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIG1P18858 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIG1P18858 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIG1P18858 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LIG1P18858 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIG1P18858 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIG1P18858 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIG1P18858 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LIG1P18858 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIG1P18858 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LIG1P18858 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIG1P18858 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIG1P18858 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIG1P18858 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIG1P18858 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LIG1P18858 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIG1P18858 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIG1P18858 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIG1P18858 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIG1P18858 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIG1P18858 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIG1P18858 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIG1P18858 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIG1P18858 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIG1P18858 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIG1P18858 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIG1P18858 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.8 ms