Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN2P17655 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CAPN2P17655 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN2P17655 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms