Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VCANP13611 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCANP13611 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCANP13611 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCANP13611 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VCANP13611 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCANP13611 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCANP13611 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCANP13611 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCANP13611 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCANP13611 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCANP13611 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCANP13611 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCANP13611 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VCANP13611 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCANP13611 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCANP13611 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCANP13611 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCANP13611 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VCANP13611 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCANP13611 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VCANP13611 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCANP13611 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCANP13611 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCANP13611 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCANP13611 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCANP13611 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCANP13611 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VCANP13611 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCANP13611 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCANP13611 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCANP13611 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCANP13611 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCANP13611 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VCANP13611 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCANP13611 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCANP13611 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCANP13611 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCANP13611 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCANP13611 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCANP13611 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCANP13611 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VCANP13611 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCANP13611 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCANP13611 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCANP13611 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCANP13611 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCANP13611 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VCANP13611 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCANP13611 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCANP13611 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCANP13611 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCANP13611 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCANP13611 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCANP13611 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCANP13611 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCANP13611 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCANP13611 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCANP13611 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCANP13611 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCANP13611 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCANP13611 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCANP13611 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCANP13611 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCANP13611 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCANP13611 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCANP13611 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCANP13611 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCANP13611 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCANP13611 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VCANP13611 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCANP13611 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCANP13611 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCANP13611 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCANP13611 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCANP13611 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCANP13611 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCANP13611 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCANP13611 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCANP13611 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCANP13611 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCANP13611 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCANP13611 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCANP13611 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCANP13611 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCANP13611 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms