Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPBGLP0DKB5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPBGLP0DKB5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPBGLP0DKB5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms